Merlin läuft auch problemlos unter Windows 7, allerdings sind hier die folgenden beiden Punkte zu beachten:

• Merlin darf nicht im Verzeichnis [PROGRAMME] installiert werden. Das Verzeichnis [PROGRAMME] ist unter Windows 7 besonders geschützt, so dass es dort Probleme mit vorhandenen Speicherbeschränkungen gibt.
  Bei 64bit Systemen gilt dies ebenfalls für das Verzeichnis "PROGRAMME (x68)"
  Für eine schon im Verzeichnis [Programme] installierte Merlin-Version können Sie das Installationsverzeichnis einfach durch Verschieben des kompletten Merlin-Verzeichnisses ändern. z. B. direkt nach C:.
  Im Anschluß an ein Verschieben müssen Sie noch die Verknüpfungen (Die Start-Icons) an das neue Verzeichnis anpassen. Hierzu die Verknüpfung mit rechts anklicken und im PopUp-Menü den Eintrag Eigenschaften auswählen. Im folgenden Fenster ändern Sie unter dem Reiter "Verknüpfungen" die Einträge hinter "Ziel:" und "Ausführen in:" auf das neue Verzeichnis. In Merlin selber brauchen Sie normalerweise keine Änderungen vornehmen, da alle benötigten Dateien relativ zum Verzeichnis Merlin gesucht werden.
• Es wird die Java-Version 1.6 ab Version 1.6_14 benötigt. Mit älteren Java-Versionen gibt es Probleme beim Bildschirmaufbau.
• Ab Merlin Version 4.5 wird mindestens Java 7 benötigt! Empfohlen wird die Nutzung der aktuellen Java 8 Version

Bei der Nutzung von Java 7 gibt es unter Windows 7 ein Problem mit der Windows-Firewall bei FTP-Verbindungen. Aufgrund eines Bugs in der Firewall werden alle FTP-Verbindungen geblockt, so dass die in Merlin vorhandenen FTP-Verbindungen nicht funktionieren. Falls sie diese benötigen, müssen sie entweder während der FTP-Übertragung die Windows Firewall ausschalten, oder Merlin über eine batch-Datei starten, in der Java angewiesen wird, nicht das IPv6-Protokoll zu nutzen. Eine derartige "Startdatei" können sie im Bereich downloads herunterladen. Speichern sie die Datei bitte direkt im Verzeichnis Merlin und legen anschließend zum vereinfachten Start eine Verknüpfung mit dieser Datei auf ihren Desktop.
Ab Merlin 4.5 ist der Befehl zur Nichtnutzung des IPv6-Protokoll direkt in Merlin implementiert, die bat-Datei zur Umgehung des Bugs wird nicht mehr benötigt.